漫画《寄宿日记》讲述的是普通上班族林北被迫搬进一栋老旧的合租公寓后，与四位背景各异、性格古怪的室友共同生活的爆笑日常。这栋公寓里住着二次元宅男、深夜主播、备考公务员的学霸和一位神秘的流浪画家。林北作为一个“正常人”，每天都在室友们匪夷所思的行为中挣扎求生，却也在这一连串混乱、窘迫又温馨的事件中，逐渐与他们建立起深厚的羁绊。他用日记记录下合租生活的点点滴滴，从最初的忍无可忍，到最后的恋恋不舍，真实地展现了都市青年合租生活的酸甜苦辣。
公寓里最神秘的画家突然消失了，只留下一幅未完成的油画。众人在寻找他的过程中，发现了他作为孤独症患者隐藏的内心世界，最终在江边找到了他，大家紧紧拥抱在一起。
临近国考，学霸室友连续通宵后精神恍惚，竟把林北的日记本当成了复习资料，在上面写了满满一页的申论答案。林北哭笑不得，却也因此见证了学霸最脆弱的一面并给予鼓励。
台风导致全城停电，众人点起蜡烛围坐在一起。主播室友讲起了鬼故事，吓得二次元宅男哇哇乱叫，大家在黑暗中放下手机，进行了一次难得的、没有网络干扰的真心话聊天。
一只流浪猫误入公寓，引发了室友们关于是否收养它的激烈争执。最后大家在楼道里为它搭了一个小窝，轮流喂养，这成了他们共同守护的第一个“家庭成员”。
深夜主播在直播时，林北穿着秋裤端着泡面闯入镜头，瞬间被直播间上万观众截图。这段意外让主播的粉丝大涨，也开启了两人的“同居CP”恶搞之路，让他们又气又好笑。
林北提着行李箱站在破旧的公寓楼下，怀疑自己是否走错。刚进门就被堆积如山的快递盒绊倒，二次元室友探出头来大喊“欢迎来到异世界”，他的合租噩梦就此拉开序幕。